应用16S rRNA序列分析法鉴定学校直饮水中细菌类型

作者:饶文燕*; 吴衍恒; 余昆英
来源:河南预防医学杂志, 2021, 32(09): 669-672.
DOI:10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2021.09.007

摘要

目的建立应用16S rRNA序列分析的方法用于鉴定学校直饮水中的细菌类型。方法选择学校直饮水在普通营养琼脂培养平板上生长的菌落,挑取单个菌落用水煮法提取核酸,采用16S rRNA通用引物扩增进行序列扩增,应用核酸蛋白分析仪对扩增片段进行电泳分析并送测序公司进行测序,测序结果通过NCBI Blast在线进行序列比对从而得出细菌类型。结果挑选27个单个菌落进行16S r RNA序列的扩增,扩增的片段经电泳分析全部得出目标条带,测序结果通过在线同源性比对鉴定出2株蜡样芽胞杆菌,2株皮氏罗尔斯顿菌,5株罗尔斯顿菌属,3株肺炎克雷伯菌,2株睾丸酮丛毛单胞菌,3株短波单胞菌属,1株鲍曼不动杆菌,1株假单胞菌属,1株草螺菌属,1株不动杆菌属,1株吉拉氏铜霉菌,1株食酸菌属,1株琼氏不动杆菌,1株人型葡萄球菌,1株鞘氨醇单胞菌,1株温和假单胞菌。结论应用16S rRNA序列分析法可以用于鉴定学校直饮水中的细菌类型。

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