基于转录组测序技术对甲状腺乳头状癌颈部淋巴结转移差异基因的分析

作者:周祖邦; 谢金会*; 时润莉; 姜自容; 薛亚娥; 张雪婷; 张明华
来源:兰州大学学报(自然科学版), 2021, 57(06): 844-852.
DOI:10.13885/j.issn.0455-2059.2021.06.018

摘要

通过对伴有颈部淋巴结转移和不伴颈部淋巴结转移的甲状腺乳头状癌组织与癌旁正常组织提取RNA进行转录组高通量基因测序,经过基因本体注释分析及京都基因和基因百科全书通路富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)找出核心差异基因,在GEPIA网站对核心差异基因进行相关性分析和无复发生存期分析.取只在伴有颈部淋巴结转移组中表达的差异基因,以P>0.05,|log2差异倍数|>1为标准,共筛选到差异基因1 467个,其中上调409个,下调1 058个,从PPI网络中筛选出关系密切的差异基因,经过相关性分析和无复发生存期分析,发现TYMS、MCM4上调, GNG11、ACKR3下调使甲状腺癌患者无复发生存期缩短. TYMS、MCM4、GNG11、ACKR3可能与甲状腺乳头状癌颈部淋巴结转移有关,可以作为甲状腺乳头状癌淋巴结转移的潜在生物学标志物.