西南地区野生刺梨的遗传多样性和遗传结构研究

作者：吴诗琪; 潘凤; 赵财^*

来源：广西植物, 2023, 43(11): 2065-2077.

• 刺梨
• 单拷贝核基因
• 叶绿体基因
• 遗传多样性
• 遗传结构

为了探究西南地区野生刺梨(Rosa roxburghii)的遗传多样性和起源演化，该研究基于2段单拷贝核基因(GAPDH和ncpGS)和3段叶绿体基因(atpF-trnH、trnL-trnF和trnG-trnS)的拼接序列，对刺梨27个野生居群共320个个体进行PCR扩增和测序，并用相关软件对测序结果进行分析。结果表明：(1)在单拷贝核基因和叶绿体基因水平上刺梨均表现出较低的遗传多样性(scnDNA:Hd=0.469 2,π=0.000 49; cpDNA:Hd=0.653 4,π=0.000 65),并且不同居群间存在较大差异。(2)分子方差分析(AMOVA)结果均显示，遗传变异主要发生在居群内，表明居群内的变异是野生刺梨遗传变异的主要来源，居群间存在明显的遗传分化(cpDNA:FST=0.336 47,GST=0.273,NST=0.308;scnDNA:FST=0.094 87,NST=0.076,GST=0.056),刺梨的分布不具有明显的谱系地理结构(P>0.05)。(3)中性检验Tajima’s D值均为不显著负值，符合中性进化模型。Fu’s Fs值均为显著负值，结合失配分析曲线，推测刺梨种群在小范围内经历过扩张，但总体上维持稳定状态。(4)根据单倍型多样性得出，毕节地区的居群遗传多样性水平较高并且拥有丰富的单倍型，推测可能为冰期避难所，因此应对其实施就地保护，对于拥有特殊性状和特有单倍型的居群也应采取优先保护措施。该文为野生刺梨资源保护和遗传育种提供了一定的参考价值。

• 单位
  生命科学学院; 贵州大学