德州驴与泌阳驴睾丸组织mRNA与microRNA表达鉴定与分析

作者：韩浩园; 李婉涛; 雷初朝^*

来源：中国畜牧兽医, 2019, 46(08): 2371-2380.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.08.022

• 驴
• 睾丸
• 转录组
• 差异表达基因
• microRNA

试验旨在探究驴睾丸组织中mRNA和microRNA的表达模式,为中国地方驴的转录组研究提供遗传数据。利用RNA-Seq和生物信息学方法分析了中国地方驴睾丸组织表达基因和microRNA,并分析了泌阳驴和德州驴品种间差异表达基因及microRNA。结果表明,mRNA平均clean reads为57 837 506条,Small RNA平均clean reads为9 952 015条,分别占原始数据的96.34%和88.86%。在驴睾丸组织中共发现24 751个表达基因及1 074个表达microRNAs,其中,睾丸组织表达量较高的基因为LOC106836782、XLOC066401、HSP90AA1、TNP1和COF2,表达量最高的microRNAs为eca-miR-143、eca-miR-21、eca-miR-99a、eca-miR-148a和eca-miR-26a。对泌阳驴与德州驴睾丸组织进行差异表达分析共发现102个差异表达基因及2个差异表达microRNAs,但未富集到功能条目,说明泌阳驴和德州驴品种间差异不明显。本研究提供了驴睾丸组织mRNA及microRNA表达模式和转录组学数据,并鉴定了泌阳驴与德州驴睾丸组织的差异表达mRNA和microRNA,对驴的遗传资源研究具有一定的科学意义。

• 单位
  动物科技学院; 西北农林科技大学; 河南牧业经济学院