基于GEO数据库永久性房颤的生物信息学分析及潜在有效药物预测

作者：周斌; 王艳; 赵明明; 刘洪云; 王英芝; 周纪星

来源：山东医学高等专科学校学报, 2023, 45(04): 262-321.

• 永久性房颤
• 基因表达
• 计算生物学

目的 探讨PAF的治疗靶点及药物，为其临床诊疗提供新的理论和方法。方法 利用GSE2240芯片，选择GPL96基因注释平台采集10例PAF患者和20例窦性心律对照者右心耳芯片数据。应用limma软件包筛选DEGs;应用clusterProfiler软件包进行GO、KEGG富集分析；应用STRING11.0在线数据库进行PPI分析，筛选关键基因；应用CMAP数据库筛选与DEGs负相关的小分子药物。结果 PAF组共筛选出184个DEGs。GO:DEGs参与多种信号通路等生物过程。KEGG:DEGs主要富集于PI3K-Akt信号通路、松弛素信号通路、AGE-RAGE信号通路、细胞外基质与其受体的相互作用、蛋白质的消化与吸收、HIF-1信号通路等。PPI:10个关键基因，其中7个表达上调，3个表达下调。成功筛选到11种与永久性房颤DEGs负相关的小分子药物，其中布美他尼、石蒜碱最有潜力成为治疗PAF的有效药物。结论 NKCC1是PAF潜在的治疗靶点；布美他尼，石蒜碱是潜在治疗PAF的有效药物。

• 单位
  临沂市中心医院