大豆GmPID基因生物信息学分析及克隆

作者：张超; 张勇; 满百膺; 伍应保; 张高阳; 张惠宁; 涂班策; 吕晶晶; 李思楠; 程鹏; 武小霞^*

来源：东北农业大学学报, 2020, 51(01): 13-22.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2020.01.002

• 大豆
• 再生
• AGC激酶
• GmPID
• 生物信息学

利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因PID作同源序列比对,从大豆中克隆PID基因全长CDS序列,得到大豆再生相关基因GmPID,分析大豆再生相关基因GmPID启动子序列、氨基酸序列、编码的蛋白质结构、亲疏水性、蛋白质结构及同源进化树。结果表明,GmPID编码区cDNA长度为1 359 bp,编码452个氨基酸,GmPID编码的蛋白为碱性亲水性蛋白;分析其蛋白功能结构域发现,GmPID蛋白含有丝氨酸/苏氨酸激酶催化结构域,为PKc-like超家族成员;构建系统进化树发现其与密花豆亲缘较近。研究结果有利于深入研究大豆再生相关基因GmPID在大豆再生过程中的关键作用,为提高大豆再生效率提供理论基础。

• 单位
  生命科学学院; 东北农业大学; 上饶师范学院