新时代高校内部权力区分政治、行政、学术和民主四种类型,高质量发展目标任务期待其运行能不断提升法治化水平。近些年来关涉高校的司法案件逐渐增多,迫切要求推进高校内部权力运行法治化建设。通过梳理发现,新时代高校内部权力运行法治化存在主体认知与运行偏差、制度制定与执行折扣以及责任关联与考核虚化的现实困境。故而,需要通过不断提升权力主体自身认知的区分度与前瞻性,持续增强权力运行规范的参与度与科学性,明确划分各自权力责任的匹配度与反馈性三个方面,探寻新时代高校内部权力运行法治化的实践路径。