miRNA-122a靶基因预测及生物信息学分析

作者:蒋永容; 陈川; 张志敏; 郑继军; 许文; 罗美林; 戴楠; 李梦侠; 杨宇馨; 李增鹏; 王东; 王阁
来源:中国肿瘤临床, 2011, (16): 931-934.

摘要

目的:利用基因芯片技术分析肝癌HepG2细胞和正常肝上皮LO2细胞中miRNA的表达,并对HepG2细胞中低表达的miRNA-122a进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为以miRNA-122a为靶点的基因治疗提供理论和实验基础。方法:利用基因芯片技术检测HepG2细胞和LO2细胞中miRNA-122a表达水平,通过生物信息学预测miRNA-122a的靶基因,并对其靶基因进行功能富集分析(GO-analysis)、信号转导通路富集分析(Pathway-analysis)和蛋白质相互作用网络分析。结果:与LO2细胞比较,miRNA-122a在HepG2细胞中呈低表达。miRNA-122a预测靶基...

  • 单位
    第三军医大学大坪医院