山东省潍坊市柯萨奇病毒A6型VP1区基因进化特征分析

作者：刘德辉; 马淑青; 聂清^*; 张凤娟; 胡林; 刘淑慧; 刘艳菊

来源：预防医学论坛, 2023, 29(06): 411-414.

DOI：10.16406/j.pmt.issn.1672-9153.2023.6.03

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A6型
• VP1区基因
• 氨基酸替代
• 选择性压力

目的 探讨2015-2020年山东省潍坊市柯萨奇病毒A6(CV-A6)VP1区核苷酸进化特征，明确潍坊市CV-A6的基本流行状况及VP1区毒力相关的氨基酸位点。方法 收集2015-2020年山东省潍坊市手足口病患者CV-A6核酸阳性标本，进行VP1区全长序列扩增及核苷酸序列测定，根据GenBank中CV-A6原型株及参考序列(含重症、轻症)进行基因分型、选择性压力分析、重症及轻症间氨基酸位点差异对比分析。结果 共获得15条915 bp VP1轻症全长序列，15条序列均位于D3a分支中，且分别与不同地域序列处于不同分支中。与轻症序列相比，重症序列VP1区的5个氨基酸替代位点S5A(χ2=13.37,P=0.001)、A30V(χ2=6.79,P=0.009)、N137S(χ2=5.40,P=0.02)、V242I(χ2=14.41,P=0.000)、A283T(χ2=14.26,P=0.000)差异均有统计学意义(P<0.05)。潍坊市CV-A6 VP1区序列中，有4条序列在两个位点与重症序列突变一致(I174V、A283T)。所有VP1序列只存在负选择压力，Ka/Ks>1,3个碱基A410G、A520G、G724A发生非同义突变，分别位于三个氨基酸替代位点N137S、I174V、V242I的密码子中，突变率与氨基酸替代率一致。结论 2015-2020年山东省潍坊市手足口病CV-A6 VP1区为轻症序列，均位于D3a分支中D3a基因亚型。重症序列中的N137S、I174V、V242I三个氨基酸位点可能与CV-A6致病性相关。

• 单位
  潍坊市人民医院; 潍坊市疾病预防控制中心