结直肠癌中差异性表达的外泌体lncRNA 功能富集及通路分析

作者：曾薇; 刘翼; 李文婷; 朱金峰^*

来源：中华全科医学, 2022, 20(01): 141-143+164.

DOI：10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.002297

• 结直肠癌
• 外泌体
• 长链非编码RNA

目的通过探讨差异性表达的外泌体lncRNA及其调控的信号通路在结直肠癌发生、发展中的作用,以期为结直肠癌的诊断和治疗提供新的靶点。方法使用R软件线性回归模型软件包limma包进行差异表达分析,根据筛选阈值得到显著差异表达的lncRNA和mRNA;通过计算差异表达lncRNA与mRNA皮尔逊相关性系数,获得其之间协同表达关系,通过相关系数筛选存在正向协同表达的lncRNA-mRNA关系对;分别对lncRNA的协同表达mRNA进行GO功能和KEGG通路富集分析,以间接预测lncRNA的功能。结果在32例健康志愿者和12例结直肠癌患者中筛选出差异性表达的外泌体lncRNA共202个、mRNA共1 014个。验证出差异性表达的lncRNA-mRNA关系对10个。对lncRNA协同表达的mRNA进行功能富集显示,差异性表达的外泌体lncRNA可能与B细胞受体信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、抗原处理与呈递信号通路和NOD样受体信号通路活化密切相关。结论深入探索外泌体lncRNA在结直肠癌中的差异性表达、功能富集及通路活化,有助于为结直肠癌的治疗提供新思路,为诊断提供新靶点。

• 单位
  深圳大学总医院; 新疆医科大学附属肿瘤医院