整合转录组数据鉴定大型真菌原基形成的潜在通路（英文）

作者：杨驰; 马璐; 肖冬来; 江晓凌; 刘晓瑜; 应正河; 林衍铨^*

来源：微生物学通报, 2022, 49(02): 556-568.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.210420

• 大型真菌
• 转录组测序
• 原基形成
• 环境因子

[背景]大型真菌子实体发育特别是从菌丝体到原基转变的分子机制,目前仍不清楚。现有的研究大多集中在有限的真菌种类或环境因素上,但对在发育中起关键作用的基因提供的信息有限。[目的]研究大型真菌原基形成的分子机制。[方法]对11个物种及4个环境因子相关的转录组数据进行分析。[结果]与对照组相比,上调基因数量从白灵菇(Pleurotus tuoliensis)的325个到梅里克氏菌(Rickenella mellea)的2 854个,下调基因数量从白灵菇的379个到圆环蜜环菌(Armillaria ostoyae)的3 189个。根据gene ontology (GO)注释,前3个生物过程类别为氧化-还原过程、代谢过程和碳水化合物代谢过程。此外,细胞成分类别中膜整体成分、核、膜等显著富集。同样地,分子功能类别包括水解酶活性、氧化还原酶活性和催化活性。[结论]大型真菌在原基形成中存在可能发挥重要作用的共同通路。

• 单位
  福建省农业科学院