食源性致病菌全基因组测序及全球数据共享平台发展趋势

作者：李晓然; 张若鸿; 杨洋^*; 崔生辉; 郭云昌

来源：中国食品卫生杂志, 2020, 32(03): 339-344.

DOI：10.13590/j.cjfh.2020.03.023

• 食源性致病菌
• 暴发
• 全基因组测序
• 全球数据共享平台

随着用于监测食源性致病菌和暴发调查的分子分型技术迅猛发展,全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)正逐渐显露出其重要性。在食品贸易全球化背景下,急需建立食源性致病菌与人类感染间联系的详尽认识,从而精确监测并减少其发生。在该方面,WGS的精确性明显优于之前的分析工具。本文主要以单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)为例,阐述食源性致病菌监测情况和感染暴发调查现状,强调WGS在食源性疾病溯源方面的价值,概述用于数据生成和分析的技术,着重介绍WGS在全球食源性致病菌分型领域的实际应用进展,并对其未来所面临的挑战进行展望。

• 单位
  中国食品药品检定研究院; 河北科技师范学院; 国家食品安全风险评估中心