摘要
[目的]获得波纹龙虾丰富的转录组信息和功能基因。[方法]利用太平洋生物平台单分子实时测序技术,对波纹龙虾鳃、肝胰腺、肌肉、性腺、眼柄等组织混合进行全长转录组测序,获得波纹龙虾全长转录文库。[结果]单分子产出的高质量测序reads总量为71.57 G,通过测序拼接和去冗余后共获得10 425个Unigene,平均长度为4 147 bp。使用GO、NR、Pfam、NT、KEGG、SwissProt、KOG等数据库对全长序列进行基因功能注释,其中9 580条序列得到NR数据库注释,分别比对到358个物种,其中与钩虾(Hyalella azteca)基因相似的序列最多,为3 865个;有7 585条序列得到GO注释;KOG功能注释将7 436条单基因簇分为26个功能组分,其中一般功能预测的最多,为1 421条;KEGG注释结果发现,心肌细胞的肾上腺素能信号、病毒性心肌炎、心脏肌肉收缩中注释的基因较多,分别为289、254和236条。[结论]通过全长转录组测序数据分析及功能注释,为进一步了解波纹龙虾的生物学特性、基因功能、相关代谢途径和信号通路等提供理论基础,为后续研究提供参考。
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