基于数据库挖掘5种胃癌干性基因在胃癌中潜在价值研究

作者：余水红; 马军; 钱燕; 龚莉

来源：牡丹江医学院学报, 2022, 43(02): 17-24.

DOI：10.13799/j.cnki.mdjyxyxb.2022.02.018

• 胃癌
• 胃癌干性基因
• 数据库和价值

目的 挖掘异常表达的胃癌干性基因LGR5、CD44、ASPM、ABCG2及PSCA在胃癌诊断、治疗及预后中的潜在生物学价值。方法 UALCAN和Oncomine数据库分析LGR5、CD44、ASPM、ABCG2及PSCA的基因表达水平；借助cBioPortal分析干性基因变异及其与患者生存之间的影响；Kaplan-Meier plotter分析干性基因表达与患者生存之间的关系；LinkedOmics分析干性基因正负相关的网络基因；MetaScape数据库分析干性基因及网络基因功能注释及基因通路；IMER数据库研究干性基因与免疫细胞浸润的相关性，并分析免疫细胞对胃癌患者生存的影响。结果 胃癌组织中LGR5、CD44及ASPM mRNA水平及DNA拷贝数高于相应的正常组织(P<0.05),ABCG2和PSCA mRNA水平低于正常组织(P<0.05),而PSCA的DNA拷贝数高于正常组织(P<0.05),ABCG2的DNA拷贝数无统计学意义；LGR5、CD44、ABCG2高表达组的总生存期明显短于低表达组(HR>1,P<0.05);ASPM高表达组长于对照组(HR<1,P<0.05);PSCA表达与胃癌患者生存期无统计学意义(HR>1,P>0.05);LGR5、ASPM及ABCG2变异类型最多的是突变变异，CD44及PSCA最多的是扩增性变异，ASPM变异可提高胃癌患者5年生存期，ABCG2变异不利于胃癌患者5年生存期，且具有统计学意义(P<0.05);功能网络分析表明5个干性基因及相关网络基因参与了细胞有丝分裂、脂肪消化吸收、MicroRNAs调节及蛋白运输等过程；干性基因的表达与CD4+ T、CD8+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞浸润水平有相关性。结论 5种胃癌干性基因的表达、突变、调节与胃癌发生发展、患者的预后及免疫细胞浸润间的关系密切相关，为进一步研究这些干性基因在胃癌中的作用奠定了基础。

• 单位
  安庆市立医院; 安庆师范大学; 安庆医药高等专科学校; 生命科学学院