DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群

作者：付小花; 李艳丽; 乐毅全; 王磊

来源：实验技术与管理, 2012, (09): 45-47+50.

DOI：10.16791/j.cnki.sjg.2012.09.013

• 优势菌群
• 定量检测
• DGGE
• 定量PCR(qPCR) dominant bacteria
• quantitatively monitoring
• DGGE technology
• quantitative PCR(qPCR)

精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义。该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量。方法:抽提样品DNA,针对16SrDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群;再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息。该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息。

• 单位
  环境科学与工程学院; 同济大学; 污染控制与资源化研究国家重点实验室; 海洋地质国家重点实验室