基于SNP标记的穞稻与栽培稻的遗传多样性分析及萌发耐淹性评价

作者：孙志广; 潘根; 陈庭木; 李景芳; 赵利君; 迟铭; 徐波; 邢运高; 刘金波; 刘晓敏; 葛高宁; 徐**; 王宝祥^*; 徐大勇^*

来源：中国农学通报, 2022, 38(30): 6-13.

• 穞稻
• 栽培稻
• SNP
• 遗传多样性
• 萌发耐淹性

旨在分析穞稻与栽培稻间的遗传多样性，为穞稻的保护和开发利用提供分子依据。以包括穞稻在内的48份水稻种质资源为试验材料，利用1K mGPS SNP芯片进行基因分型，使用PowerMaker 3.25软件进行UPGMA聚类分析。结果表明，4785对多态性SNP标记共检测出9570个等位基因，平均每对标记检测出2个等位变异；多态性信息含量(PIC)变化范围为0.0400～0.5957，平均值为0.3123，基因多样性指数(GD)变化范围为0.0408～0.6667，平均值为0.3839。UPGMA聚类分析将48份参试种质划分为2个亚群，即籼稻亚群和粳稻亚群，其中穞稻分属于粳稻亚群。厌氧萌发耐受性评价表明，穞稻具有很强的耐低氧萌发能力，可为适宜直播水稻的培育提供重要的种质基础，同时本研究为穞稻优异基因的挖掘和利用提供理论基础。

• 单位
  连云港市农业科学院; 生命科学学院; 南京农业大学; 中国农业科学院麻类研究所; 苏州农业职业技术学院