泛癌中SMYD3的表达与预后及免疫浸润之间的关系

作者：陈浩然; 司甜; 姜懿珅; 王殿恒; 周雅博; 吕家迪^*

来源：基础医学与临床, 2023, 43(01): 68-75.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2023.01.0068

• SMYD3
• 泛癌分析
• 免疫浸润
• 免疫逃逸
• MHC-Ⅰ类分子

目的 研究SMYD3表达在泛癌中的预后价值，分析SMYD3对于肿瘤组织免疫浸润的影响。方法 从TCGA、GTEx、HPA等数据库收集基因表达矩阵以及蛋白质表达等数据。使用Kaplan-Meier算法评价了SMYD3在不同肿瘤中的预后价值。使用ESTIMATE算法和Timer数据库的信息分析SMYD3与免疫浸润的关系。以小鼠黑色素瘤细胞系B16为例，在细胞水平验证SMYD3对抗原提呈基因表达的影响。结果 转录组和蛋白组学数据表明SMYD3在肿瘤组织中表达升高，并且SMYD3的高表达和泛癌的不良预后相关(P<0.05);SMYD3抑制了多种免疫细胞的浸润(P<0.05),敲除Smyd3的B16细胞抗原呈递基因表达水平升高(P<0.05)。结论 Smyd3是一个重要的肿瘤预后相关基因，其通过下调抗原递呈基因的表达，抑制免疫细胞浸润，诱导肿瘤细胞免疫逃逸。

• 单位
  北京协和医学院; 中国医学科学院基础医学研究所; 医学分子生物学国家重点实验室