水稻OsCAT2的Crispr/cas敲除植株的全基因表达谱分析

作者：王联红; 刘家林; 欧阳林娟; 傅军如; 贺浩华; 朱昌兰; 彭小松; 贺晓鹏; 陈小荣; 边建民; 徐杰; 孙晓棠; 周大虎; 胡丽芳^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5640-5646.

DOI：10.13417/j.gab.039.005640

• 水稻
• 过氧化氢酶
• OsCAT2
• 差异基因

为了进一步了解水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的分子机制及其调控网络,本研究以野生型及OsCAT2基因的Crispr/cas转基因敲除植株为材料进行基因芯片分析。通过差异基因的筛选共获得5 483个差异表达基因,其中3 248个上调表达,2 235个下调表达。通过GO功能注释发现,差异基因在二价金属离子运输、锌-Ⅱ离子运输、次生代谢产物生物合成过程和二价无机阳离子转运代谢途径中显著富集;通过KEGG通路分析发现,差异基因在次生代谢产物的生物合成、植物-病原互作、光合作用、氰基氨基酸代谢和类黄酮生物合成途径中显著富集。进一步分析发现,差异表达基因中还包括一系列与植株分蘖数及抗性相关的基因。该研究为深入探讨水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的作用机制提供了理论参考。

• 单位
  江西省超级稻工程技术研究中心; 作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室; 江西农业大学; 双季稻现代化生产协同中心