本实用新型涉及一种脑起搏器及脑起搏器的控制系统,该脑起搏器包括:光发射结构、至少1个光传导部件;光传导部件与设定人体脑内神经核团相连接;光发射结构,与光传导部件相连接,用于发出光信号并耦合进光传导部件;光传导部件用于将光信号传导至设定人体脑内神经核团,抑制设定人体脑内神经核团的电冲动。采用上述脑起搏器或脑起搏器的控制系统能够通过光发射结构和光传导部件通过光信号的传输抑制丘脑体核团的兴奋程度。