小菌素是由肠道菌分泌的一类小分子抑菌肽,分子量小于10kDa,由细菌质粒或基因组上相关基因簇编码,小菌素的抑菌谱较窄,仅对肠道菌中部分亲缘较近的菌种发挥有效的抑菌效应。编码小菌素的基因簇一般包括几个部分:前体基因,自身免疫基因,分泌基因,转录后修饰基因。与很多微生物通过非核糖体途径分泌抑菌物质不同,小菌素前体通过核糖体途径分泌。目前已发现的小菌素有15种,它们的结构和抑菌机制具有多样性。