2013—2017年西安市流行麻疹病毒的基因特征分析

作者：李焱; 马超锋; 吴瑞; 韩月雯; 习艳丽; 陈海龙; 徐纪茹^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2019, (02): 142-147.

• 麻疹病毒
• 核蛋白
• 基因变异

目的 了解2013—2017年西安市麻疹流行毒株核蛋白(nucleoprotein,N)的基因变异。方法 疑似麻疹病例的咽拭子标本经Real-time RT-PCR检测为麻疹病毒核酸阳性的,在Vero－SLAM细胞上分离病毒,提取毒株核酸,用One-Step RT-PCR法扩增毒株和Ct值低的咽拭子核酸的N基因,测序后分析。结果 共获得30条麻疹流行毒株N基因羧基末端序列,经鉴定均为H1a亚型。流行毒株之间的核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.3%～100%和96.7%～100%,其与疫苗株S191为91.3%～92.2%和87.3%～90.0%,与疫苗株C47为92.2%～92.7%和88.0%～90.7%。西安市流行毒株与安徽省、甘肃省、山东省、河南省、吉林省野病毒的同源性高于山西省、四川省、湖南省与广东省。流行毒株与两条疫苗株氨基酸序列比较,变异较多(熵值较高)的位点是422、457和497、467和500。467位点的突变只存在于2017年。dN/dS＝0.199,未发现正选择位点。结论 2013—2017年西安市麻疹流行毒株的优势基因型是H1a亚型,近两年病毒基因多样性在减少,应加强病原学监测,为麻疹消除提供证据。

• 单位
  西安交通大学; 基础医学院; 西安市疾病预防控制中心