子宫内膜癌内源竞争RNA网络的构建及综合分析

作者：乔峰; 张旭^*

来源：西南师范大学学报(自然科学版), 2021, 46(11): 15-22.

DOI：10.13718/j.cnki.xsxb.2021.11.003

• 子宫内膜癌
• TCGA
• ceRNA网络
• 生物标志物
• Cox风险评分系统

本研究基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的子宫内膜癌基因表达数据集,通过基因差异表达分析共鉴别出1 906个mRNA、 753个lncRNA和56个miRNA在EC样本中的异常表达.然后对鉴别出的1 906个差异表达的mRNA进行GO功能富集分析和KEGG通路分析.基于筛选出的差异基因,构建了一个包含66个mRNA、 16个miRNA和66个lncRNA的内源竞争RNA(ceRNA)调控网络.在这个网络中,16个mRNA, 5个lncRNA和1个miRNA的表达量与EC患者的总体生存率密切相关(P.value<0.01).通过多变量Cox回归,构建了一个包含5个lncRNA的风险评分系统,对EC患者生存期具有良好的鉴别和预测能力.本研究深入挖掘了EC的分子相互作用机制并进一步缩小了靶向lncRNA的范围,将有助于EC的早期诊断、预后及新的治疗策略的制定.

• 单位
  重庆师范大学