健康人群不同年龄组肠道菌群特征预测模型的研究

作者：赵敏; 吴竞; 李丛勇; 赵义名; 薛万国; 孙刚^*; 石金龙^*

来源：解放军医学院学报, 2019, 40(08): 734-739.

• 肠道菌群
• 随机森林算法
• 健康人群

目的利用16S测序数据建立健康人年龄段预测模型,探索不同年龄组肠道菌群特征。方法基于SRA数据库中2016年923例16S测序数据筛选特征操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),应用随机森林算法建立幼儿园学生、小学生、中学生、青年人、中年人、老年人和长寿老人7个年龄段预测模型,分析组间菌群差异特征及功能,计算特征OTUs与组间差异通路的相关性。结果基于278个与年龄变化相关的OTUs建立随机森林年龄段预测模型,准确率达到72.9%;不同年龄组之间存在249个显著差异通路,主要是异生素生物降解和代谢、脂质代谢和氨基酸代谢通路;在菌群组成和功能层面聚类分析,学生组和中年人组聚为一类,青年人组、老年人组和长寿老人组聚为一类。结论预测模型以及组间聚类结果均说明学生组和中年人组肠道菌群相似,老年人、长寿老人与青年人之间的菌群特征更相近。

• 单位
  解放军总医院