高粱过敏性诱导反应基因家族HIR的鉴定及表达分析

作者：陈俊; 方远鹏; 杜巧丽; 蒋君梅; 任明见; 李向阳; 田山君^*; 谢鑫^*

来源：中国粮油学报, 2021, 36(07): 161-168.

• 高粱
• HIR基因家族
• 胁迫
• 表达分析

为研究高粱HIR基因家族成员的表达特性,采用生物信息学分析方法和实时荧光定量(qRT-PCR)技术,对高粱HIR基因家族进行鉴定和分析。结果表明:高粱中有5个HIR成员(SbHIR1～SbHIR5),分布于高粱第2、3、7、9、10号染色体上;系统进化分析发现高粱与玉米的亲缘关系最近;不同物种间及物种内HIR基因的有效密码子数相对保守;基因结构分析表明,高粱HIR基因内含子数为1～6个;Motif分析表明,高粱SbHIR2蛋白缺失Motif 5和Motif 8,其余高粱HIR成员均具有9个Motif;高粱HIR蛋白二级结构以α-螺旋为主;qRT-PCR分析显示,高粱HIR基因家族成员在根、茎和叶中表达量存在差异,且能响应脱落酸、赤霉素和flg22的胁迫。

• 单位
  贵州大学