基于生物信息学分析长链非编码RNA SNHG7在口腔鳞状细胞癌中的表达水平及预后的关系

作者：颜孟雄; 高桂林^*

来源：临床口腔医学杂志, 2021, 37(05): 296-299.

• 口腔鳞状细胞癌
• SNHG7
• 预后

目的:基于生物信息学分析长链非编码(lncRNA)SNHG7在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)中的表达水平,探究其与OSCC预后的关系。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载研究号为GSE42743的OSCC芯片数据,该数据集取自74例OSCC样本及29例癌旁正常口腔黏膜样本,首先对基因探针的注释,分析SNHG7在癌与癌旁正常组织的表达水平;其次评估SNHG7的表达水平与OSCC样本临床特征和预后的关系。采用KEGG通路分析SNHG7表达水平在OSCC中可能的致病机制。结果:SNHG7在OSCC中的表达高于正常对照组(P<0.001)。SNHG7的表达水平与肿瘤分期呈正相关(P<0.05),SNHG7高表达组的总生存率明显差于低表达组(Log-rank P=0.001 15)。Cox回归分析提示SNHG7高表达为OSCC预后不良的独立预测因素(P=0.004);KEGG基因富集分析提示,SNHG7主要参与代谢通路、癌症相关通路、MAPK信号通路、cGMP-PKG信号通路、核糖体合成等生物学过程。结论:SNHG7在OSCC样本中高表达与OSCC患者的临床进展有关,可作为OSCC预后评估的潜在标记物。

• 单位
  恩施土家族苗族自治州中心医院