癫痫伴全面性发育迟缓患儿1例的临床特征及 PAK1基因变异分析

作者：袁梦; 张佳; 李杨; 罗欢; 张金秀; 甘靖^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2023, 40(05).

• 癫痫
• 全面性发育迟缓
• 大头畸形
• PAK1基因
• 全外显子组测序
• 儿童

目的探讨1例癫痫伴全面性发育迟缓患儿的临床特征与遗传学病因。方法选取2021年4月1日于四川大学华西第二医院小儿神经科就诊的1例癫痫伴全面性发育迟缓患儿为研究对象。收集患儿临床资料, 抽取患儿及其父母外周静脉血样, 应用全外显子组测序(WES)对患儿进行基因检测, 采用Sanger测序进行家系验证, 并对候选变异进行生物信息学分析。设定检索年限为2000年1月1日至2021年5月31日, 在万方数据知识服务平台、中国知网、PubMed、ClinVar、Embase等数据库中, 检索PAK1基因变异相关性癫痫病例报道, 对该病患儿临床表型及PAK1基因变异情况进行总结。结果患儿为男性, 2岁2个月, 临床表现为癫痫、全面运动发育迟缓与大头畸形。WES检测结果提示, 患儿携带PAK1基因c.1427T>C变异。经Sanger测序验证, 患儿父母PAK1基因均为野生型, 提示患儿为新发变异。生物信息学分析:PAK1基因c.1427T>C变异在dbSNP、OMIM、HGMD及ClinVar等数据库中, 仅见1篇文献报道。在ExAC、1000 Genomes及gnomAD等数据库中, 亚洲正常人群该变异未见携带频率。IFT、PolyPhen-2、LRT、Mutation Taster及FATHMM等在线软件预测结果均提示该变异对编码蛋白功能影响可能有害。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)制订的《序列变异解释的标准和指南》, 该变异评级为可能致病性变异。结论 PAK1基因c.1427T>C变异可能为该癫痫伴全面性发育迟缓患儿的遗传学病因。本研究为该病患儿临床诊断与遗传咨询提供了参考依据。

• 单位
  四川大学华西第二医院