摘要
为筛选适宜广藿香(Pogostemon cablin)不同栽培品种、不同组织基因表达分析的内参基因。本研究根据广藿香转录组和文献查阅,筛选出11个候选内参基因。通过实时荧光定量PCR,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCT和RefFinder等方法对11个候选基因在广藿香不同栽培品种(湛香, 南香, 肇香, 牌香)、不同组织(根, 茎, 叶)中的表达稳定性进行分析。结果显示,候选内参基因在不同栽培品种广藿香不同组织中的表达稳定性存在差异。在同一栽培品种不同组织中,UBC可作为湛香的理想内参基因,UBQ10可作为南香的理想内参基因,EF1α可作为肇香的理想内参基因,EIF5A可作为牌香的理想内参基因。在同一个组织不同栽培品种中,EIF6可作为根的理想内参基因,actin97可作为茎的理想内参基因,UBC可作为叶的理想内参基因。在不同栽培品种不同组织(总样品)中,EIF4E可作为理想内参基因。本研究筛选出各组表达最稳定的候选内参基因,为广藿香基因差异表达研究提供可靠的内参基因,确保广藿香基因表达分析结果的可靠性。对研究广藿香功能基因以及了解不同栽培品种广藿香基因表达差异机制乃至品种选育、充分利用广藿香资源至关重要。
- 单位