利用SNP标记解析速生优质杉木群体的遗传多样性与结构

作者：黄荣; 胡德活; 邓厚银; 王润辉; 韦如萍; 晏姝; 郑会全

来源：分子植物育种, 2021, 1-10.

• 杉木
• SNP
• 遗传多样性
• 遗传结构
• 核心种质

对育种群体遗传多样性及遗传结构的了解有助于林木的遗传改良。本研究基于SLAF-seq技术探究杉木[Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook.]第三轮遗传改良计划所获得的速生优质(生长和木材基本密度皆优)杉木种质群体的遗传多样性与遗传结构，并捕获核心种质。利用SLAF-seq技术共获得949 997个SLAF标签，其中238 459个(25.10%)具有多态性。基于上述多态性SLAF标签开发出1 408 468个SNP标记，筛选143 871个SNP位点用于速生优质杉木群体遗传多样性参数进行估算，结果显示群体的He、Ho和I分别为0.209 5，0.273 1和0.432 0，表明群体具有较高的遗传多样性。无性系间遗传距离范围从0.000 5至0.241 5，平均0.153 1。最大似然法聚类和基于Admixture软件进行的遗传结构分析结果显示110个无性系可分成3个聚类分支。最后确定了核心子集core 0.5为关键的核心种质群体，该群体涵盖55个无性系，涵盖3个遗传分组，且几乎保留全部的遗传多样性，表明捕获的核心种质遗传基础较宽泛，可作为下一轮杉木速生优质品系杂交组合的亲本。本研究结果为杉木种质资源的有效保存、亲本选配制种提供了重要依据。

• 单位
  广东省林业科学研究院; 医药学院; 南方医科大学