1株鸡滑液囊支原体的分离鉴定与全基因组分析

作者：许李锋; 贾晨宇; 陈福再; 方梦园; 刘孝丹; 陈吉龙; 李训良^*

来源：畜牧兽医学报, 2022, 53(08): 2663-2676.

• 鸡滑液囊支原体
• 分离鉴定
• 全基因组测序
• 基因功能注释分析

鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae, MS)能引起家禽呼吸道疾病、传染性滑膜炎、蛋壳顶端异常及生长迟缓等，给全球养禽业带来巨大的经济损失。然而不同国家和地区MS的耐药性和致病性存在差异，因此本研究旨在挖掘福建MS菌株的特征。作者采集福建省疑似患MS的病鸡关节腔内容物，对菌株进行分离鉴定，并利用三代联合二代测序技术对其进行全基因组测序。结果显示，该分离株病原特性稳定，已保藏至中国典型培养物保藏中心，保藏编号为CCTCC No.:M 2021210,并将其命名为MS-FJ01。MS-FJ01基因组全长为795 381 bp, GC含量为28.39%;预测编码基因数为704个，占整个基因组的90.48%;并在COG、GO和KEGG数据库分别注释到476、382、425个基因。通过各数据库的分析，注释了40个耐药相关基因，4个碳水化合物相关酶基因，136个病原与宿主互作相关基因，47个毒力因子相关基因，106个膜转运蛋白相关基因，25个限制修饰相关基因。通过与MS HN01和MS 5-9基因组进一步比较发现，MS-FJ01与这两个中国菌株均存在良好的共线性关系，且与MS 5-9的亲缘关系更近。本研究阐明了福建MS菌株的基因组结构、通过相关数据库的分析，预测和注释了其基因的功能，为深入研究MS提供参考依据。

• 单位
  动物科学学院; 福建农林大学