基于RNA-seq的黑麦rbcS基因家族鉴定与低温表达分析

作者:卢悦; 李浩男; 范力文; 关慧敏; 周书阁; 何晨光; 张委勇; 王晓萍*; 赵海滨*
来源:分子植物育种, 2023, 1-13.

摘要

1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶是植物光合作用的关键酶,rbcS作为其中一个小亚基在逆境胁迫中发挥重要作用。本研究基于黑麦转录组筛选该家族成员并分析其基序与响应低温表达情况,共筛选出11个rbcS家族成员,分别定位在1R、2R、5R和7R染色体上。该家族蛋白的氨基酸数在174~191 aa之间,其中ScrbcS03和ScrbcS05基因编码同一种蛋白,是一种不稳定的亲水蛋白。亚细胞定位预测表明家族蛋白都主要定位在线粒体中,且都包含ribulose-bisphosphate carboxylase small chain结构域。qRT-PCR试验验证该家族基因与低温逆境的响应,表明rbcS基因参与短期低温处理,而长期低温胁迫下该家族基因几乎不表达。