希尔斯山羊草1SsS和3SsS染色体特异dCAPS标记的建立

作者：倪佳俊; 韩冉; 徐文竞; 王开; 祁广; 曾小雪; 訾妍; 李豪圣; 刘建军; 汪晓璐^*; 刘成^*

来源：山东农业科学, 2023, 55(05): 15-21.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2023.05.003

• 小麦
• 希尔斯山羊草
• 基因组重测序
• SNP分析
• dCAPS标记

希尔斯山羊草是小麦的近缘种，具有抗病、抗逆、抗虫等优异性状，是小麦遗传改良的珍贵基因源。当前，我们创制了一批小麦-希尔斯山羊草杂交种质。然而，由于缺乏分子标记，上述种质无法被有效筛选和鉴定。为了建立希尔斯山羊草染色体特异分子标记，本研究通过对希尔斯山羊草基因组重测序，发掘希尔斯山羊草和小麦间单核苷酸多态性(SNP),选择150个多态性位点开发dCAPS标记，结果发现，相比中国春等小麦对照，利用引物AESD23和AESD105经PCR和酶切电泳后分别能在希尔斯山羊草中获得长度不同的多态性条带。利用一套中国春-希尔斯山羊草二体附加系和端体附加系对这些多态性条带进行定位，结果发现，AESD23能在中国春-希尔斯山羊草1Ss二体附加系和1SsS端体附加系中扩增出长度为1 800 bp的多态性条带，而AESD105能在中国春-希尔斯山羊草3Ss二体附加系和3SsS端体附加系中扩增出长度为200 bp和300 bp的多态性条带。对小麦-希尔斯山羊草杂交种质检测发现，AESD23和AESD105均能对小麦-希尔斯山羊草杂交种质进行有效筛选和鉴定。因此，上述3个多态性片段可以作为dCAPS标记用于检测含希尔斯山羊草1SsS或3SsS染色质的材料，为检测和追踪小麦背景中希尔斯山羊草染色质提供了新的检测手段。

• 单位
  鲁东大学; 山东省农业科学院作物研究所