摘要
目的 基于生物信息学分析,探讨结直肠癌的转移机制并为其提供潜在的治疗靶点。方法 从GEO数据库下载Ⅰ~Ⅲ期结直肠癌淋巴结转移的转录组测序表达谱数据并进行差异表达分析,通过Cytoscape、Funrich等软件对结直肠癌转移相关基因进行筛选。采用Western blot法检测结直肠癌细胞中IL15、Rac1、E-Cadherin、N-Cadherin、Slug和Vimentin的表达,采用细胞划痕实验及Transwell实验检测IL15沉默对SW620和LoVo细胞系迁移和侵袭的影响。结果 通过极大系中心系数算法、GO和KEGG富集等生物信息学分析手段,设定不同的P值作为限定条件,建立3个基因子集,通过筛选及KEGG和PPI分析,发现NK细胞介导的细胞毒反应与结直肠癌关系密切,其中IL15被显著富集并显示与结直肠癌相关蛋白具有显著相关性(P<0.05)。抑制IL15导致Rac1及EMT相关蛋白表达发生上调,通过细胞划痕实验及Transwell实验发现,抑制IL15能够促进SW620和LoVo细胞的迁移和侵袭。结论 IL15沉默促进了结直肠癌细胞系的EMT进程,IL15是结直肠癌转移的抑制因子。
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