基于叶绿体DNA序列的多基原黄精分子鉴定

作者：丛悦; 李莉^*; 张金霞; 关佳莉; 拱健婷; 王大仟; 赵艺萌

来源：中国现代中药, 2021, 23(12): 2072-2076.

DOI：10.13313/j.issn.1673-4890.20210104007

• 黄精
• 叶绿体DNA
• 遗传距离
• 系统发育树
• 分子鉴定

目的:通过分析rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列变异特点,评价其对3种不同基原黄精的鉴定能力。方法:分别提取3种基原黄精总DNA,以rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序。采用MEGA 5软件寻找其特异位点,计算样品K2-P (Kimura 2-parameter)遗传距离,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)系统聚类树。结果:rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列长度分别为722～737、293、457～531 bp,简约信息位点占比分别为0.4%、1.0%和2.4%。rpl20-rps12和psbA-trnH序列中种内最大遗传距离均小于种间最小遗传距离。基于3个序列构建的NJ树显示,3种基原黄精都表现出良好单系性,能明显区分。结论:从序列特点和种内、种间变异性综合分析,rpl20-rps12序列更适宜黄精的基原鉴定。