一种新的定量16S rRNA基因扩增子测序方法

作者：韩娜; 彭贤慧; 张婷婷; 强裕俊; 李秀文; 张雯

来源：生物工程学报, 2020, 36(12): 2548-2555.

DOI：10.13345/j.cjb.200353

• 16S rRNA
• 扩增子
• 定量
• 随机标签
• 内参

近年来,16S扩增子测序技术被广泛应用于肠道微生物菌群结构和多样性研究,同时也常被用于临床样本中未知病原菌的检测。然而其对样本中物种组成的分辨率只能到属水平的相对丰度,且实验过程中多种因素皆可对结果产生一定影响,如样本起始浓度、PCR循环数、扩增引物等。为解决以上问题,本研究采用随机标签和内参法相结合的方法,开发了一套定量16S扩增子测序方法,将常规的16S rRNA编码基因测序结果中的相对丰度转化为绝对定量的拷贝数,有效提高了肠道菌群结构检测的精准性,降低了实验操作对结果的影响,也提高了测序与其他分子生物学方法间的可比性,有利于未来技术的进一步研发和改进。

• 单位
  传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所