青海湖地区5株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列进化分析

作者：刘琳玉; 姜双应; 汪立杰; 易虎; 赵生仓; 唐志坚; 徐翠玲; 董婕; 高荣保; 张烨; 邹淑梅; 李晓丹; 杨磊; 杨静; 陈涛; 舒跃龙

来源：病毒学报, 2014, 30(02): 109-118.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002487

• H9N2
• 禽流感病毒
• 基因组
• 分子特征
• 遗传进化分析

2012年79月从来源于青海湖地区活禽市场的环境样本中分离到5株H9N2亚型禽流感病毒,为了了解其基因遗传进化情况,本研究通过RT-PCR技术扩增分离毒株的8个基因片段,并进行全基因序列测定。对其分子特征及全基因序列进行遗传进化分析。结果显示5株病毒的HA基因片段的核苷酸相似度为93.2%99.1%。NA基因核苷酸的相似度为94.5%99.8%。A/environment/qinghai/017/2012的裂解位点为PSKSSRGLF,其它4个毒株的HA裂解位点均为PSRSSRGLF。5个病毒的HA基因第226位受体结合位点均为L。M1基因片段中发生了N30D和T215A替换。遗传进化分析表明5株病毒同2005年湖南分离的A/chicken/Hunan/5260/2005(H9N2)毒株类似,为一种重配基因型禽流感病毒。其中HA、NA、NS基因片段属于Y280-like支系,MP基因片段属于G1-like支系,NP、PB1、PB2、PA四个基因片段属于F98-like支系。

• 单位
  青海省疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所