狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析

作者：李国辉; 曹愉夏; 薛倩; 张会永; 殷建玫; 朱云芬; 沈海玉; 窦新红; 苏一军; **华; 邹剑敏^*; 韩威^*

来源：中国畜牧兽医, 2021, 48(03): 954-962.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2021.03.019

• 狼山鸡
• 近交
• 卵巢
• RNA-seq测序
• 差异基因

为了探究近交对繁殖效应的影响,本研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为素材,结合分子标记和系谱信息,组建高、低近交两个试验组,记录高、低近交组的繁殖性能数据。选取高、低近交组中正常个体各3只,采取卵巢组织进行RNA-seq测序,并对差异基因进行功能注释。结果在高、低近交组中共获得差异转录本1 114个,其中783个基因获得注释,307个上调,476个下调。GO和KEGG分析表明,差异基因主要富集在核糖体的生物合成、炎性反应、繁殖、生长、免疫系统过程、代谢过程等生物学过程,Pathway显著富集在叶酸的生物合成、卵母细胞成熟和代谢等生物学通路。功能分析发现,筛选出的差异基因(如GGH、CPEB1、GNMT和PIWIL等)与繁殖功能相关。此外,还包括一些与应激和免疫相关的基因(如APOC3、HSP70、CD38和LGMN等)。研究结果有助于了解狼山鸡繁殖性状近交衰退相关的基因及其调控机制,为家禽特定性状近交衰退分子机理提供参考。

• 单位
  江苏省家禽科学研究所