先天性小耳畸形微小RNA综合调控网络的生物信息学分析

作者：郭蕊; 杨庆华^*

来源：世界最新医学信息文摘, 2019, 19(51): 114-117.

DOI：10.19613/j.cnki.1671-3141.2019.51.072

• 先天性小耳畸形
• microRNA
• 靶基因
• 长链非编码RNA
• 调控网络

目的构建以miRNA为中心的综合调控网络,探讨关键miRNA、靶基因、转录因子、长链非编码RNA与先天性小耳畸形发病间的关系,为进一步明确病因提供新的研究思路。方法分析小耳畸形残耳软骨与健侧耳软骨间miRNAs差异表达谱,基于24个差异表达的miRNAs,预测靶基因、转录因子和长链非编码RNA,构建综合调控图并对关键节点进行生物信息学分析。结果基于24个差异miRNAs,共预测到154个靶基因,209个转录因子和22个长链非编码RNA。MiR-221/222-3p、miR-320c、miR-3122、miR-4521,靶基因ZEB2、TRPS1、GNAI3、SHOC2、PDPK1、PDPK1,...

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院