基于益生菌调节的太平鸡回肠SNP位点分析

作者：雒林通; 马芳^*; 唐德富; 包晓娟

来源：安徽农业科学, 2020, 48(21): 86-94.

• 太平鸡
• 益生菌
• 回肠
• 转录组测序
• SNP

为挖掘益生菌调节下太平鸡回肠SNP位点,将120只太平鸡随机分为对照组与益生菌组,采用高通量测序技术对太平鸡回肠转录组的SNP位点进行分析。结果显示:SNP类型中,转换类型明显高于颠换类型,对照组中转换类型占22.55%～27.45%,颠换类型占11.43%～13.87%;益生菌组与对照组结果相似,转换类型(22.53%～27.46%)明显高于颠换类型(11.37%～13.94%)。SNP位置分析表明,对照组和益生菌组总SNP位点分别为4 684 072和4 647 171个,其中位于内含子和基因间区的SNP位点最多。另外,在SNP功能分析中,同义突变SNP占比最高,在对照组和益生菌组中分别占7.01%和7.10%;非同义突变SNP在对照组和益生菌组中占比分别为2.97%和2.98%。该研究结果可为今后太平鸡的分子标记开发、遗传连锁图谱构建以及辅助育种等提供基础数据。

• 单位
  天水师范学院; 甘肃农业大学