猪链球菌wzy基因与血清型别的相关性分析

作者：王建平; 杜鹏程; 白雪梅; 郑翰^*

来源：疾病监测, 2018, 33(12): 990-994.

• 猪链球菌
• wzy基因
• 基因组
• 血清分型

目的分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性。方法建立了33个已知血清型(1～31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1～20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对。结果 767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21。94.13%(722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致。在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异。结论基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法。

• 单位
  首都医科大学附属北京地坛医院; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室