文冠果果实转录组测序及分析

作者：赵阳阳; 郭雨潇; 张凌云^*

来源：生物技术通报, 2019, 35(06): 24-31.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-1101

• 文冠果
• 果实
• 转录组测序
• SSR标记

为了研究文冠果果实转录组中功能基因表达情况,采样RNA-seq技术对文冠果不同发育时期果实进行测序分析。结果显示:两个时期样品材料测序组装后共获得68 298个Unigene序列,有24 691个Unigene得到注释,占36.15%;GO数据库注释显示14 766条Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程3大类54个功能组;KOG数据库中注释到的13 994条Unigene功能系统分为25类;以KEGG代谢途径数据库为依据,可将8 284个文冠果果实转录组Unigene分为127个代谢通路;在文冠果果实转录组中发现11 732个SSR位点,其中最多的为单核苷酸SSR,占60.85%。本研究为文冠果果实分子生物学研究提供了一定的基础和参考。

• 单位
  北京林业大学