表皮生长因子受体基因突变临床检测方法学比较及其影响因素分析

作者：钱晓燕; 王帅; 沈胤晨; 吴获; 张志尚; 冯云; 韩晓红; 石远凯

来源：中华医学杂志, 2015, 95(02): 106-111.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2015.02.007

• 肺肿瘤
• 表皮生长因子受体
• 基因突变
• 直接测序
• 楔形探针扩增阻滞突变系统

目的比较临床常用的两种方法检测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变状态结果的差异,探讨福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片标本的不同保存方式对DNA数量、质量及对检测结果的影响。方法收集中国医学科学院肿瘤医院2010年11月至2011年8月晚期NSCLC FFPE组织切片标本150份,分别采用楔形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions ARMS)和直接测序法检测EGFR第18、19、20、21号外显子突变状态,分析两种方法检测EGFR基因突变结果的差异,对结果不一致病例收集临床治疗情况及生存数据并进行分析。对其中30份FFPE标本提取DNA并保存于-20℃3年,同样的30份FFPE标本按常规方法保存3年后再提取DNA,比较两种保存方式对DNA的数量、质量及对检测结果的影响。结果 Scorpions ARMS法检测EGFR基因突变的成功率(100%)高于直接测序法(87.3%),差异有统计学意义(x2=20.28,P<0.05)。两种方法检测EGFR基因突变的一致率为84.7%,一致性较好(Kappa=0.738,P<0.001)。分析结果不一致病例中5例接受靶向药物治疗后患者的生存情况,与ARMS检测结果一致性相对较好。新鲜FFPE标本提取并贮存于-20℃、3年的DNA与FFPE标本按常规方法保存3年后提取的DNA相比,后者质量相对较差,片段化程度更严重,但两种保存方法获取的DNA的EGFR基因突变检测结果均一致。结论 Scorpions ARMS与直接测序法联合检测结果更为全面、可靠。检测结果不确定的患者应以临床治疗及生存资料支持诊断。FFPE标本提取DNA后低温贮存,更有利于DNA完整性的保存。

• 单位
  中国医学科学院肿瘤医院; 北京协和医学院