结核分枝杆菌Rv3248c生物信息学分析及同源建模

作者：周放; 项杰; 占卫红; 王培东; 何俊才; 余晓丽; 张可^*

来源：武汉轻工大学学报, 2019, 38(03): 27-31.

• 结核分枝杆菌
• Rv3248c
• 生物信息学
• 同源建模

运用生物信息学方法对结核分枝杆菌Rv3248c进行结构功能分析及同源建模。通过NCBI、BLAST、ProtParam和Interproscan等生物信息学方法对Rv3248c进行同源性、理化性质、保守序列、跨膜、信号肽二级结构和三级结构预测分析。结果显示Rv3248c的氨基酸序列与腺苷高半胱氨酸水解酶高度一致,该蛋白包含495个氨基酸,没有跨膜及信号肽结构,其二级结构α螺旋占43%,无规则卷曲占41.8%,β折叠占15.2%,利用同源建模法构建该蛋白的三级结构,并对该模型进行质量评估。研究结果有望对结核病的诊断和治疗提供参考。为进一步研究该蛋白质的结构与功能打下基础。

• 单位
  武汉市医疗救治中心; 武汉轻工大学