基于COⅠ基因的5种新疆土著鱼类DNA条形码鉴定及聚类分析

作者：强壮; 赵年桦; 张旦旦; 秦凯瑞; 聂竹兰^*; 李立伟; 钟馨; 胡仁云

来源：塔里木大学学报, 2023, 35(04): 16-25.

• 裂腹鱼属
• DNA条形码
• COⅠ基因
• 物种鉴定
• 遗传距离

为探讨DNA条形码技术在新疆土著鱼类物种鉴定中的有效性并保护本土渔业重要种质资源，本研究采用DNA条形码技术对裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)和高原鳅属(Triplophysa)鱼类进行COⅠ基因序列扩增，并与NCBI数据库进行序列比对，结合遗传距离和系统发育树进行物种鉴定分析。结果表明，33尾个体分属4属5种，其中有13个单倍体；COⅠ基因序列中(G+C) mol%值为46.7%,远小于(A+T) mol%值53.3%,表现出明显的反G偏倚，第三位密码子处的(G+C) mol%值为55.9%,远高于第一和第二密码子处的(G+C) mol%值，R值(转换/颠换)为2.10;种间平均遗传距离(11.55±0.95)%,为种内平均、遗传距离(0.14±0.10)%的43.8倍，远远大于Hebert所提出的“10倍法则”;系统发育树表明，裂腹鱼亚科和高原鳅属鱼类分为两支，其中，裂腹鱼亚科的塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi)、宽口裂腹鱼(Schizothorax eurystomus)、扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)、斑重唇鱼(Diptychus maculatus)的同种不同个体各自独立聚为一支，显示出明显的单系性；高原鳅属中的长身高原鳅(Triplophysa teunis)也独自立为一支，所有物种都被区分开。综上，基于COⅠ基因的DNA条形码技术可以有效鉴定新疆5种土著鱼类。

• 单位
  塔里木大学