普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析

作者:赵振祥; 崔露莹; 周东波; 赵泽玉; 张银霞; 盖梦琦; 解敏敏; 蒲文宣; 彭宇; 李志远*
来源:中国烟草科学, 2022, 43(04): 70-78.
DOI:10.13496/j.issn.1007-5119.2022.04.010

摘要

Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物的多种生命进程中发挥着重要作用。为解析烟草中Dof家族成员在生长发育过程中的潜在作用,本研究利用比较基因组学、进化分析、共线性分析等方法解析烟草中的Dof家族成员的潜在生物学功能。结果表明,在烟草基因组中共鉴定到69个Dof转录因子,其Dof功能域在进化上十分保守,根据系统进化分析结果将其划分为9个亚家族。共线性分析表明,烟草中的16个Dof基因与拟南芥17个Dof基因有27个共线性基因对,同时,25个Nt Dof基因被检测到存在17个全基因组复制对,表明复制事件在烟草Dof基因家族的扩张中起关键作用。此外,表达模式分析表明Nt Dof基因的表达存在明显的组织特异性,其中NtDof05和NtDof28基因可能与根系生长发育有关。本研究对烟草基因组中的Dof转录因子进行了系统的鉴定和分析,为烟草Dof转录因子家族成员的功能研究奠定了基础。

  • 单位
    湖北中烟工业有限责任公司; 湖南中烟工业有限责任公司; 中国农业科学院烟草研究所

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