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摘要
西藏拟南芥是近年于青藏高原地区发现的一个新的拟南芥生态型，现已成为研究植物高原适应性的模式材料。图位克隆是分离目标基因的常用手段之一，然而有效分子标记的缺少严重阻碍了西藏拟南芥对高海拔适应机制的研究。本研究对西藏拟南芥基因组进行组装，获得了相对完整的西藏拟南芥基因组，并通过BLAST序列比对筛选和重新设计了一套均匀分布于5条染色体的InDel分子标记引物。结果表明，实验验证的119对InDel分子标记引物中，54对引物在西藏型和哥伦比亚型之间具有多态性；其中37对引物扩增效果最好，在2%琼脂糖凝胶中即可产生清晰的多态性条带，并用于后续研究。初定位连锁图表明，西藏拟南芥株高矮化基因定位于4号染色体9.3～16.2 Mb区间。本研究开发的分子标记能够有效对西藏拟南芥进行基因分型，为西藏拟南芥的正向遗传研究奠定了基础。
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单位亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室; 华南农业大学; 广东省农业生物蛋白质功能与调控重点实验室; 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
