大肠杆菌O138 O-抗原基因簇的破译及Gne的生物信息学鉴定

作者：孔庆科; 程剑松; 赵广; 王磊; 郭宏杰; 郭玺

来源：微生物学报, 2004, 44(6): 756-760.

DOI：10.3321/j.issn:0001-6209.2004.06.012

• 大肠杆菌O138
• O-抗原
• 特异基因
• UDP-GlcNAc C4异构酶

利用鸟枪法对大肠杆菌E.coli O138 O-抗原基因簇进行测序,序列全长14139bp,用生物信息学的方法进行序列分析,共发现11个基因,分别为鼠李糖合成酶基因(rmlB, rmlD, rmlA, rmlC)、UDP-GalNAcA合成酶基因(gne, gna)、糖基转移酶基因(3个)、O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy).发现一种稀有单糖UDP-GalNAcA的合成途径,对合成该糖的第一种酶Gne进行了生物信息学鉴定,另外用PCR方法筛选出了针对大肠杆菌O138的特异基因.

• 单位
  南开大学; 生命科学学院