鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性研究进展

作者：王娜; 海荣; 俞东征

来源：中国媒介生物学及控制杂志, 2011, (02): 190-193.

• 鼠疫菌
• 全基因组
• 单核苷酸多态性 Yersinia pestis
• Whole genome sequence
• Single nucleotide polymorphisms

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,包括同义SNPs(synonymous SNPs,sSNPs)和非同义SNPs(non?synonymous SNPs,nSNPs)。随着测序技术的迅速发展,获得了大量细菌全基因组序列,使得通过测序技术及生物信息学方法寻找潜在的SNPs位点成为可能。并且,由于SNPs本身的特性,使其作为一种新的分子标记,在细菌分型与进化、流行病学调查研究中得到广泛应用。该文主要阐述基于全基因组寻找SNPs位点,并建立以SNPs数据为基础的鼠疫菌微进化研究分...

• 单位
  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室