不同流行区间日疟原虫疫苗候选抗原pvama1基因DⅠ结构域的种群结构分析

作者：何洋; 孙林; 曹雅明; 朱晓彤^*

来源：中国免疫学杂志, 2018, 34(10): 1441-1445.

• 间日疟原虫
• pvama1
• 基因多态性
• 种群结构

目的:明确中缅边境流行区间日疟原虫(P.vivax) pvama1基因DomainⅠ(DⅠ)区域的多态性和种群结构。方法:提取16例中缅边境P. vivax感染患者血gDNA; PCR和测序检测其pvama1基因DⅠ区域,参考韩国、泰国和巴布新几内亚(PNG)流行区相应序列,采用Dna SP6. 10. 1和Structure软件进行多态性、中性检验和种群结构分析。结果:成功扩增16例中缅边境pvama1基因DⅠ区;各流行区pvama1基因的DⅠ区π值为0. 0130. 021,且dN/dS>1(P<0. 05)。PNG流行区Tajima’s D~*值显著大于1(P<0. 05);各流行区pvama1基因分为3个亚群(K=3)。结论:Pvama1基因DⅠ区具有低多态性并经历阳性选择,提示其为红内期疫苗候选靶位;中缅边境、泰国和PNG流行区具有相似的种群结构,提示以其主要单倍体型为基础设计的疫苗具有广泛的保护作用。

• 单位
  中国医科大学; 基础医学院