柠条锦鸡儿CkTTG1基因克隆及其生物信息学分析

作者：孟玲; 田菊; 高仙灵; 王瑞刚; 李国婧^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-15.

• 柠条锦鸡儿
• TTG1
• 基因克隆
• 生物信息学分析

TRANSPARENT TESTA GLABRA1 (TTG1)基因在调节植物的表皮毛和刺的形成过程中均发挥着重要作用。为了探索该基因在柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii Kom.)托叶刺发育中的功能，本研究以柠条锦鸡儿为材料，基于基因组序列信息设计特异性引物，克隆得到CkTTG1基因，并构建了表达载体。该基因具有936 bp的开放阅读框，编码311个氨基酸。对该基因编码的蛋白进行生物信息学分析后发现，CkTTG1分子质量为34.85 kD，等电点为5.03，是不稳定的亲水性蛋白。对该蛋白进行保守基序分析和保守结构域预测发现，CkTTG1具有典型的WD40-repeat结构域，属于WD40超家族。多重序列比对及系统进化分析表明，CkTTG1与其他植物中TTG1蛋白有较高的一致性，与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的TTG1一致性达到86.26%，进化关系最近。对柠条锦鸡儿和拟南芥WD40家族进行系统发育分析发现，二者WD40家族成员均匀分布于7个组中。本研究为进一步揭示CkTTG1的功能提供了初步的分子基础。

• 单位
  呼和浩特职业学院; 内蒙古农业大学