Asia1型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析

作者:郑海学; 靳野; 尚佑军; 郭建宏; 田宏; 杨亚民; 刘湘涛; 才学鹏
来源:微生物学通报, 2010, (09): 1312-1319.
DOI:10.13344/j.microbiol.china.2010.09.023

摘要

为了查明Asia1型FMDV第Ⅴ群猪源和牛源毒株的序列差异,采用RT-PCR方法,对Asia1型FMDV第Ⅴ群猪源分离毒株Asia1/HN/06的基因组全序列进行了扩增和测序,并与第Ⅴ群牛源和猪源参考毒株基因组进行比较分析。结果表明,Asia1/HN/06毒株全基因组序列长约8236nt[含38个A的poly(A)尾],其中5'NCR长1116nt,前导蛋白(L)编码区长603nt,结构蛋白与非结构蛋白编码区的核苷酸序列为6990nt,3′NCR长93nt,3′端是至少含有38个A的poly(A)尾巴。猪源毒株和牛源毒株的全基因比较分析表明,属于第Ⅴ群,全基因编码区核苷酸和氨基酸的同源性均为9...

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